Em Yauaretê, a população indígena está estimada em 13.148 habitantes, que vivem nas calhas dos Rios Waupés e Tiquié, no extremo Noroeste da Amazônia brasileira. São pertencentes às etnias Tukano, Dessana, Tariano, Piratapuia, Tuyuka, Hupda, entre outros.
Yauaretê foi também uma povoação de grande importância durante a história mais recente de colonização da região. Serviu como ponto de referência para inúmeros viajantes que percorreram a área desde o final do século XVIII, para seringueiros e comerciantes que exploravam a mão-de-obra indígena e, finalmente, como base para os Missionários Salesianos que em 1930 implantaram ali uma grande missão dedicada à catequese dos índios.
Em cinco décadas de funcionamento, seus internatos receberam centenas de alunos indígenas. No fim dos anos 80, foram construídos em Yauaretê um pelotão do Exército e uma pista de pouso, no âmbito de um programa de defesa e colonização da fronteira norte-amazônica, o chamado Projeto Calha Norte.